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這種化合物廣泛應用于生物醫學研究和熒光成像。在生物醫學領域，Sulfo-Cyanine5 dUTP可用于標記和追蹤DNA。例如，通過DNA聚合酶將Sulfo-Cyanine5 dUTP摻入到DNA鏈中，可以實現DNA的熒光標記和檢測。在細胞生物學中，Sulfo-Cyanine5 dUTP可用于熒光成像，實時監測DNA的動態變化。例如，通過熒光顯微鏡觀察，可以研究DNA在細胞內的分布和代謝過程。

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